src/Util.jl

Tue, 19 Nov 2019 10:23:58 -0500

author
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
date
Tue, 19 Nov 2019 10:23:58 -0500
changeset 4
59fd17a3cea0
parent 0
888dfd34d24a
child 7
900a7e18ca01
permissions
-rw-r--r--

Add __precompile__() for what it is worth

0
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
1 #########################
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
2 # Some utility functions
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
3 #########################
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
4
4
59fd17a3cea0 Add __precompile__() for what it is worth
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents: 0
diff changeset
5 __precompile__()
59fd17a3cea0 Add __precompile__() for what it is worth
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents: 0
diff changeset
6
0
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
7 module Util
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
8
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
9 ##############
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
10 # Our exports
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
11 ##############
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
12
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
13 export map_first_slice!,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
14 reduce_first_slice,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
15 norm₂,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
16 γnorm₂,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
17 norm₂w,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
18 norm₂²,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
19 norm₂w²,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
20 norm₂₁,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
21 γnorm₂₁,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
22 dot,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
23 mean,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
24 proj_norm₂₁ball!,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
25 curry,
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
26 ⬿
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
27
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
28 ########################
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
29 # Functional programming
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
30 #########################
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
31
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
32 curry = (f::Function,y...)->(z...)->f(y...,z...)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
33
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
34 ###############################
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
35 # For working with NamedTuples
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
36 ###############################
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
37
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
38 ⬿ = merge
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
39
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
40 ######
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
41 # map
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
42 ######
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
43
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
44 @inline function map_first_slice!(f!, y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
45 for i in CartesianIndices(size(y)[2:end])
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
46 @inbounds f!(@view(y[:, i]))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
47 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
48 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
49
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
50 @inline function map_first_slice!(x, f!, y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
51 for i in CartesianIndices(size(y)[2:end])
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
52 @inbounds f!(@view(x[:, i]), @view(y[:, i]))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
53 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
54 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
55
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
56 @inline function reduce_first_slice(f, y; init=0.0)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
57 accum=init
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
58 for i in CartesianIndices(size(y)[2:end])
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
59 @inbounds accum=f(accum, @view(y[:, i]))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
60 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
61 return accum
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
62 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
63
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
64 ###########################
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
65 # Norms and inner products
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
66 ###########################
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
67
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
68 @inline function dot(x, y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
69 @assert(length(x)==length(y))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
70
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
71 accum=0
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
72 for i=1:length(y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
73 @inbounds accum += x[i]*y[i]
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
74 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
75 return accum
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
76 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
77
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
78 @inline function norm₂w²(y, w)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
79 #Insane memory allocs
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
80 #return @inbounds sum(i -> y[i]*y[i]*w[i], 1:length(y))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
81 accum=0
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
82 for i=1:length(y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
83 @inbounds accum=accum+y[i]*y[i]*w[i]
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
84 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
85 return accum
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
86 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
87
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
88 @inline function norm₂w(y, w)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
89 return √(norm₂w²(y, w))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
90 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
91
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
92 @inline function norm₂²(y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
93 #Insane memory allocs
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
94 #return @inbounds sum(i -> y[i]*y[i], 1:length(y))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
95 accum=0
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
96 for i=1:length(y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
97 @inbounds accum=accum+y[i]*y[i]
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
98 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
99 return accum
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
100 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
101
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
102 @inline function norm₂(y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
103 return √(norm₂²(y))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
104 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
105
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
106 @inline function γnorm₂(y, γ)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
107 hubersq = xsq -> begin
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
108 x=√xsq
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
109 return if x > γ
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
110 x-γ/2
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
111 elseif x<-γ
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
112 -x-γ/2
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
113 else
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
114 xsq/(2γ)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
115 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
116 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
117
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
118 if γ==0
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
119 return norm₂(y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
120 else
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
121 return hubersq(norm₂²(y))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
122 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
123 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
124
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
125 function norm₂₁(y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
126 return reduce_first_slice((s, x) -> s+norm₂(x), y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
127 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
128
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
129 function γnorm₂₁(y,γ)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
130 return reduce_first_slice((s, x) -> s+γnorm₂(x, γ), y)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
131 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
132
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
133 function mean(v)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
134 return sum(v)/prod(size(v))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
135 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
136
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
137 @inline function proj_norm₂₁ball!(y, α)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
138 α²=α*α
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
139 y′=reshape(y, (size(y, 1), prod(size(y)[2:end])))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
140
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
141 @inbounds @simd for i=1:size(y′, 2)# in CartesianIndices(size(y)[2:end])
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
142 n² = norm₂²(@view(y′[:, i]))
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
143 if n²>α²
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
144 y′[:, i] .*= (α/√n²)
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
145 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
146 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
147 end
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
148
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
149 end # Module
888dfd34d24a Initialise
Tuomo Valkonen <tuomov@iki.fi>
parents:
diff changeset
150

mercurial